Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX15Q9NRS6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX15Q9NRS6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms