Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms