Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scp2d1Q9DAH1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms