Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc83Q9D4V3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms