Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nol3Q9D1X0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms