Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl28Q9D1B9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms