Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms