Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQM1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CQM1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms