Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GpnmbQ99P91 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GpnmbQ99P91 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms