Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PccbQ99MN9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PccbQ99MN9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PccbQ99MN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 316.9 ms