Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg5Q99J83 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms