Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHACTR3Q96KR7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHACTR3Q96KR7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHACTR3Q96KR7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms