Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VOPP1Q96AW1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VOPP1Q96AW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms