Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SptssbQ925E8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SptssbQ925E8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms