Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim59Q922Y2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim59Q922Y2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms