Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atl3Q91YH5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atl3Q91YH5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atl3Q91YH5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms