Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00612Q8N6U2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00612Q8N6U2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms