Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLFN12Q8IYM2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLFN12Q8IYM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms