Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMC1Q7Z7K0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMC1Q7Z7K0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms