Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT25Q7Z3Z0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms