Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lamp3Q7TST5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms