Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim12Q78RX3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms