Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC73Q6ZRK6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC73Q6ZRK6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms