Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbf1Q6ZPE2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbf1Q6ZPE2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sbf1Q6ZPE2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms