Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAMD1Q6SPF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms