Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnip4Q6PHZ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms