Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt39Q6IFX4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms