Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usf2Q64705 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usf2Q64705 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms