Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clcn1Q64347 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn1Q64347 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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Clcn1Q64347 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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Clcn1Q64347 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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Clcn1Q64347 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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Clcn1Q64347 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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Clcn1Q64347 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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Clcn1Q64347 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn1Q64347 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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Clcn1Q64347 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms