Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pafah1b2Q61206 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms