Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phf12Q5SPL2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf12Q5SPL2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms