Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp13Q5BKP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp13Q5BKP2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp13Q5BKP2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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