Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr1d1Q3UV55 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms