Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrc1Q3UPH1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc1Q3UPH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms