Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3U595 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3U595 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3U595 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3U595 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3U595 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3U595 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3U595 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms