Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbxip1Q3TVI8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pbxip1Q3TVI8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms