Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIP11Q15643 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms