Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 MUP3YHL036W 1641 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YGR051CYGR051C 324 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 AUR1YKL004W 1206 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 TIS11YLR136C 858 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YLR462WYLR462W 609 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 PRX1YBL064C 786 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 COA2YPL189C-A 207 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 ICY2YPL250C 411 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 RTS1YOR014W 2274 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 FBP26YJL155C 1359 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SPC105YGL093W 2754 nt3.6□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YNR065CYNR065C 3351 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 MSK1YNL073W 1731 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 BMH1YER177W 804 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 HTA2YBL003C 399 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 PFA4YOL003C 1137 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SNF8YPL002C 702 nt3.59□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 BAR1YIL015W 1764 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 SPR6YER115C 576 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 MAG1YER142C 891 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 ECO1YFR027W 846 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YHI9YHR029C 885 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 LDB18YLL049W 540 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YMR147WYMR147W 672 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 RPL18AYOL120C 561 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 OSW1YOR255W 837 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 MNR2YKL064W 2910 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 BUD6YLR319C 2367 nt3.58□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 MAF1YDR005C 1188 nt3.57□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YDR230WYDR230W 348 nt3.57□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YGR273CYGR273C 525 nt3.57□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 WRS1YOL097C 1299 nt3.57□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 RGS2YOR107W 930 nt3.57□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 RNY1YPL123C 1305 nt3.57□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 BUD27YFL023W 2391 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 RTK1YDL025C 1863 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YER137C-AYER137C-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YER159C-AYER159C-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YJR026WYJR026W 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YJR028WYJR028W 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YAR010CYAR010C 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YML040WYML040W 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YML045W-AYML045W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YMR051CYMR051C 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 MIG3YER028C 1185 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 CNB1YKL190W 528 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 DCS1YLR270W 1053 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YLR402WYLR402W 192 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 SSO1YPL232W 873 nt3.56□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 RSC58YLR033W 1509 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 TRX3YCR083W 384 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 FAP7YDL166C 594 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 API2YDR525W 330 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YLF2YHL014C 1218 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 IRC25YLR021W 540 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YPT7YML001W 627 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YOR379CYOR379C 339 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YPL088WYPL088W 1029 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 FDH2YPL275W 711 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YPL278CYPL278C 303 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 IME4YGL192W 1803 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 URA2YJL130C 6645 nt3.55□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 HOS2YGL194C 1359 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 PMT6YGR199W 2280 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 NAT1YDL040C 2565 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 PHO92YDR374C 921 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 SPT3YDR392W 1014 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 FMC1YIL098C 468 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 PER33YLR064W 822 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 IST1YNL265C 897 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YOR338WYOR338W 1092 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 MGR2YPL098C 342 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 DSS4YPR017C 432 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 RER1YCL001W 567 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 LOS1YKL205W 3303 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 DPH6YLR143W 2058 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 FLO9YAL063C 3969 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 SPB4YFL002C 1821 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 GPI1YGR216C 1830 nt3.54□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 SYT1YPR095C 3681 nt3.53□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 ERD2YBL040C 660 nt3.53□□□□□ -1.84
MSH5Q12175 YNR071CYNR071C 1029 nt3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms