Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP1-1Q07627 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRTAP1-1Q07627 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms