Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox9Q04887 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms