Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PrkcqQ02111 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkcqQ02111 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkcqQ02111 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms