Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc35b1P97858 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms