Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cct7P80313 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cct7P80313 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cct7P80313 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms