Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cux2P70298 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cux2P70298 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux2P70298 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux2P70298 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux2P70298 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux2P70298 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux2P70298 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux2P70298 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux2P70298 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux2P70298 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms