Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp3P63024 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp3P63024 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp3P63024 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp3P63024 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp3P63024 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp3P63024 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp3P63024 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp3P63024 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp3P63024 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp3P63024 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp3P63024 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp3P63024 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp3P63024 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp3P63024 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms