Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl30P62889 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl30P62889 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms