Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl23aP62751 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23aP62751 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms