Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RhobP62746 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RhobP62746 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RhobP62746 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RhobP62746 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RhobP62746 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RhobP62746 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RhobP62746 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RhobP62746 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms