Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms