Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm5P62322 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms